1、早產兒：胎齡越小，胎兒消化系統的協調功能越差，胃腸激素水平也相對較低，早產兒的胃排空能力與足月兒相比是延遲的，而且早產兒的下食管括約肌發育不成熟，非常容易發生胃食管反流的現象。
2、食管下端括約肌異常的新生兒：食管下端括約肌由環狀肌組成，通過神經肌肉作用保持一定張力，靜息時有一定壓力，使下端食管關閉，阻止胃內容物反流到食管，當此肌肉功能缺陷時，則發生胃食管返流。