絕大多數的卵圓孔未閉是能夠自行好轉的，絕大部分是無需治療的。正常的情況下，卵圓孔在一週歲內自行閉合。如果超過三週歲還沒完全閉合，才診斷為卵圓孔未閉。如果發現孩子沒有任何的症狀，可以等到三歲再做決定。如果是很小的卵原孔未閉，右向左分流量很小，可以採取保守治療的策略。如果卵圓孔引起右向左分流很大，可以經皮卵圓孔未閉封堵術的微創治療。