肛周膿腫疼痛是很正常的。因為肛周膿腫時一個化膿性的炎症改變，膿腫累及皮下組織，並且在此間隙內形成的較為深部膿腫，此外肛周神經系統豐富，炎症刺激肛周神經可引起非常劇烈的疼痛。並且當膿腫形成時，膿腔內的壓力逐漸增大，可導致肛周出現明顯的脹痛，而且由於肛周的組織比較疏鬆，肛周膿腫會沿著周圍疏鬆的間隙向腹股溝區及會陰部播散，引起大面積的感染，從而可誘發更劇烈的疼痛。