肛瘻手術要住院多久還是需要看選擇的手術方式及術後的癒合情況來定。肛瘻簡單的可以分為高位肛瘻、低位肛瘻。低位肛瘻大多數是採取肛瘻切開術，手術原理是把異常瘻道切開，然後讓其慢慢生長，修復肛門瘻道。採取肛瘻切開術一般需要住院一週到二週左右，而且出院後還有可能需要換藥一個到三個月左右，另外高位肛瘻如果採取的掛線手術，那住院的時間還會長一些。