先天性食管憩室按部位分為：
1、咽食管憩室：發生於咽食管連接處後壁，環嚥肌上方的憩室。
2、食管中段憩室：發生於食管中段氣管分叉水平的憩室。
3、膈上憩室：發生於食管膈肌水平的憩室。