心臟移植手術風險是大的，它是一個高風險手術。在植入體內30天內，有可能就出現供心衰竭，可能是因為供體本身引起，也可能是因為受體因素影響。使供體在植入體內，沒有達到正常心臟功能的作用。也會出現因為肺動脈高壓、心肌缺血耐受性減低、右冠狀動脈內進入氣栓或腦死亡毒素而導致的移植心臟的右心室衰竭。心臟因為壓力和持續運動，在心臟移植的四個吻合可能會引起出血。感染是心臟移植術後死亡的重要原因。