胃腸間質瘤靶向藥物主要包括舒尼替尼、瑞格替尼，伊馬替尼等等。靶向藥物是指直接針對腫瘤細胞進行破壞，殺死癌症細胞，可以避免對全身器官的損害，所以常常代替免疫性藥物進行治療。當然靶向藥物治療主要是根據病理類型以及基因檢測結果決定的。對於錯過了手術時期的胃間質瘤，可以通過靶向藥物達到一定的效果，但是費用相對較高。