如果懷疑囊腫扭轉、囊腫破裂，或卵巢體積較大，如直徑＞5cm，隨訪3-6個月後囊腫持續存在，就可以進行手術治療，可以做腹腔鏡下手術或者開腹手術，來明確診斷和治療。
卵巢囊腫的手術具體怎麼做，需要根據患者的病情、是否存在癌變的風險進行具體手術操作，可以進行囊腫的剝除手術、卵巢的切除手術，以及附件切除手術，包括卵巢和輸卵管的切除，像絕經後婦女出現卵巢囊腫，需要進行切除手術。