卵巢囊腫分為良性的、惡性的、生理性的和病理性的，生理性囊腫的特色是不會太大，來過一次月經以後囊腫有可能明顯變小，甚至消失，但是在下一次月經前有可能又出現類似的囊腫。如果一個囊腫出現以後經過2-3個月複查快速消失，稱之為生理性囊腫，這是不嚴重的。
如果發現囊腫時，經過三個月以後囊腫迅速長大，或者一發現囊腫，囊腫就大於6cm，同時伴有血的CA125增高，就要考慮會不會是惡性的。如果年齡比較大，囊腫出現要特別警惕，因為卵巢囊腫特別是年齡大的卵巢囊腫，同時伴有血的腫瘤標記物升高，它的惡變率會很高。