黴菌性陰道炎少數的患者可以通過性交接觸傳染，例如有些男性攜帶念珠菌或者包皮過長，沒有做包皮環切的男性，其配偶患病的風險會增加。但是黴菌性陰道炎主要的傳播途徑是內源性的傳播，念珠菌除寄生於陰道，也可以寄居在人的口腔、腸道。病原體在不同的寄生部位之間會互相的傳染，一旦條件合適就可以引起感染，少數患者通過間接傳染而被感染，可以通過接觸汙染的衣物而間接被感染。