滴蟲也叫陰道毛滴蟲，是滴蟲陰道炎的致病的微生物，陰道毛滴蟲適合在25-40℃的潮溼環境中生長，因此特別適合隱藏在陰道皺襞中或者腺體內。陰道毛滴蟲可以除陰道以外，還隱藏在尿道、尿道旁腺、前庭大腺等等這些地方。因此如果想治癒這個病，最好是採取全身用藥，主要的治療藥物是甲硝唑，口服藥物的治癒率達到90%以上，因此效果還是比較明顯的。但是服藥以後有一些輕度的胃腸道反應，比如食慾減退、噁心、嘔吐，偶爾還會見到皮疹、白細胞減低等等。
如果不能夠耐受口服藥物和不適合全身用藥的人，可以選擇陰道的局部用藥。因為滴蟲由於性傳播，因此性伴侶應該同時進行治療，而且治療期間應該禁止性生活。