高級別上皮內瘤變通常是指異常細胞和組織結構異常，累及到上皮層的上半部分，甚至累及全層上皮，一般包括重度異型增生和原位癌。主要原因是在致癌因素作用下，使上皮細胞或結構發生改變導致浸潤癌的發生，既可有形態異型性，也可無形態異型性病變。高級別上皮內瘤變主要是具有惡性潛能的非浸潤病變，發生高級別上皮內瘤變後及時進行治療可完全治癒。