葡萄胎化療以後出現耐藥是比較棘手的難題，在葡萄胎病例當中，僅佔20%左右。對於復發耐藥病例，可以採用二線化療藥物，並且聯合化療方案。常用的藥物有異環磷酰胺，鉑類，博來黴素，紫杉醇等。在藥物選擇上，需要聯合應用，比如應用順鉑，長春新鹼，加博來黴素。預防葡萄胎化療耐藥，需要在治療以前準確的分期和評分，給予規範的化療方案，可以減少耐藥和復發。