前庭大腺囊腫多數是難以治癒的，小的前庭大腺囊腫可能會自然的消失，但可能會反覆發作，如果影響到日常的生活或者反覆的發作就需要進行手術治療。藥物治療效果比較差，可以進行巴氏腺囊腫造口術，目的是排出囊腔內的囊液，達到治療囊腫的目的。如果反覆的發作或者明顯的增大，影響日常生活或者導致局部不適的感覺，也可以進行切除的手術，切除巴氏腺及其導管就可以達到根治性治療的目的。