慢性腹瀉患者首先要進行大便檢查，包括大便隱血試驗、白細胞塗片檢查、紅細胞、胃消化食物、寄生蟲卵、蘇丹三色糞便脂肪染色、糞便塗片檢查、細菌真菌塗片、糞便細菌培養等。血液檢查包括血常規、血電解質、肝腎功能、血氣分析、胃腸激素或多肽測定。對胃腸胰腺和神經內分泌腫瘤，所致分泌性腹瀉的診斷和鑑別，具有重要意義。小腸吸收功能實驗，包括木糖吸收試驗、維生素b12吸收試驗等。