陰道縱隔的患者多數沒有症狀，少部分患者有性交發生困難或者是性交時疼痛；也有部分患者合併雙子宮，雙宮頸以及腎臟發育不良，會出現不孕。縱隔偏向一側，也可能引起經血瀦留、分泌物異常等。
一、典型症狀
1、性交困難：不完全性陰道縱隔可能阻礙陰莖的進入，不能完成正常性生活。
2、疼痛：在進行性生活時受阻而引起疼痛。
二、其他症狀
陰道縱隔者如合併子宮畸形，可能還會伴有不孕。縱隔偏向一側，也可能引起經血瀦留、分泌物異常等。部分患者在分娩時受阻才發現和確診。