對於妊娠合併鉅細胞病毒感染的孕婦來說，積極治療是正確之選。鉅細胞病毒感染者多無臨床症狀，此類無症狀患者無需抗病毒治療。而對於有症狀感染者的治療可應用各種抗病毒藥物，但這些藥物並不能解決根本問題，往往停藥後病毒又潛伏地回升。
一、藥物治療
1、核苷類似物抗病毒製劑：阿昔洛韋進入體內轉化為三磷酸化合物，後者干擾病毒DNA聚合酶的作用，抑制 DNA的複製。阿糖胞苷和阿糖腺苷抗病毒作用比阿昔洛韋弱，屬於妊娠期C類用藥，孕婦用藥安全性尚未確定，靜脈滴注，用於治療部分先天性鉅細胞病毒感染兒，有抑制鉅細胞病毒排出的作用。更昔洛韋抗鉅細胞活性強於阿昔洛韋10~100倍，早期用藥效果好。
2、非核苷類廣譜抗病毒藥物：膦甲酸鈉，其作用是抑制活動性病毒感染，不能治癒，但可為有先天嚴重感染的病兒爭取神經系統發育時間，對耐阿昔洛韋的鉅細胞病毒感染也有效。該藥有腎毒性、電解質失衡等不良反應，為防止發生低血鈣，應補充維生素D和鈣劑。妊娠期婦女不推薦使用，哺乳期婦女服用本品應當停止哺乳。
3、干擾素：大劑量干擾素能抑制病毒血症，使病情稍見好轉，孕婦慎用。
4、轉移因子：有增強機體細胞免疫功能的作用，對治療先天性鉅細胞病毒感染有一定效果。
二、手術治療
產科處理妊娠早期確診孕婦鉅細胞病毒感染，立即行人工流產終止妊娠或等待至妊娠20周時抽取羊水或臍靜脈血，檢測鉅細胞病毒SIgM抗體，若為陽性，則應行妊娠中期引產中斷妊娠，以免出生先天性缺陷兒。妊娠晚期感染，視胎兒有無畸形而定，妊娠足月後，可經陰道分娩，因胎兒可能已在宮內感染鉅細胞病毒。