男性備孕可以掛生殖科、男科或者泌尿外科，主要看醫院科室的配備情況。如果有生殖中心的，可以掛生殖中心的男科去檢查。如果有專門的男科和男性科的，也可以去進行檢查。
男性備孕的檢查項目是不一樣的，最基本的檢查就是精液常規。通過精液常規來了解精子的密度、活力、形態，這些指標可以用來幫助評估男性的生育能力。其他的檢查包括B超、性激素、生化、感篩等，沒有一個統一的標準。但是備孕最基本的檢查肯定是精液常規，只有精液常規才能夠評估男性的生育能力。如果精液常規有異常，需要根據異常的情況去選擇性的再進行深入的檢查，比如說B超、性激素，甚至染色體、基因檢測等。