藥流流乾淨的判斷標準是在吃藥的第三天胚胎組織排出的過程中，可以看一下是否有完整的絨毛組織排出，藥物流產之後的出血一般是10天干淨，藥物流產如果出血10天左右停止，而且後面也沒有再繼續出血，這種情形認為就是流乾淨了，必要的時候也可以做B超檢查看流乾淨沒有。藥流後如果出血持續時間大於14天，就高度懷疑藥物流產沒有流乾淨，做經陰道的超聲可以看宮腔內有沒有殘留物，如果有的話就需要再次清宮。