心房顫動藥物轉律目前主要是普羅帕酮和胺碘酮，普羅帕酮更適用於無器質性心臟病基礎的病人，胺碘酮適用於有器質性心臟病基礎的病人或者普羅帕酮轉律無效的病人。
房顫發生超過48小時，轉律前要進行抗凝治療，轉律前要做心臟超聲檢查，最好是食道超聲，明確左房是否有血栓形成，如果有血栓存在，是轉律的禁忌症。房顫發生時間不明確，轉律前要抗凝治療，包括華法林或者新型口服抗凝藥、低分子肝素的使用。胺碘酮使用前要進行肝腎功能、甲狀腺功能以及肺部CT檢查，注意藥物副作用。