第三代試管嬰兒技術，指的是在胚胎進行移植之前，針對胚胎進行了基因檢測。它適合於有父母一方，或者父母雙方存在染色體異常或者存在單基因疾病的夫婦。還有一些是反覆種植失敗，或者反覆流產的高齡夫婦，也可以做第三代的試管嬰兒。
第三代試管嬰兒的程序，在進行胚胎培養之前和其他的一代和二代的試管嬰兒程序一樣，也是先進行夫妻雙方的體檢，然後籤協議進入週期超促排卵，合適的時機取卵。取卵之後把卵子和精子交給實驗室，進行二代受精這樣的方式完成受精。然後進行胚胎培養，等胚胎培養到囊胚階段，取囊胚的滋養層幾個細胞，針對這幾個細胞進行基因的篩查，篩查之後把基因正常的胚胎冷凍起來進行移植。
所以，做第三代試管嬰兒，進行的是解凍胚胎的移植。因為在取活檢的當天，活檢的結果是沒有辦法得到。所以在取活檢的當天，也就是囊胚階段，先進行單個囊胚的冷凍，等活檢的結果出來之後把異常的胚胎丟棄，正常的胚胎留著，以後進行解凍進行移植。