子宮性不孕多數患者可經短期治療改善症狀，具體治療方式需要根據發病原因決定，如存在炎症的患者可通過抗生素治療，子宮發育異常的患者可應用促排卵藥物治療。存在子宮畸形以及各類增生性疾病需進行手術治療改善。
一、一般治療
注意增強體質以增進健康，糾正患者貧血和營養不良的狀況，積極治療各種內科疾病，針對檢查結果做出相應治療。
二、藥物治療
1、抗生素：持續性子宮內膜炎的患者可給予抗生素治療。
2、促排卵藥物治療：對於子宮發育不良且有生育計劃的女性，時使用促排卵藥物，如氯米芬治療。
三、手術治療
子宮畸形患者多采用手術治療，矯治生殖器官畸形，合併泌尿道畸形者同時予以矯治。對於子宮黏膜下肌瘤、較大的肌壁間肌瘤、子宮內膜息肉、宮腔粘連或縱隔子宮顯著影響宮腔形態，建議手術治療。包括宮腔鏡和腹腔鏡手術。