關於兒童恐懼症的病因並沒有一個系統性的研究，大多認為兒童恐懼症的來源較多，包括家庭教育、特殊經歷和遺傳因素等，都對發病有一定的影響。
1、家庭教育：父母對孩子溺愛，過度限制兒童的行動；用嚇唬、威脅的方法對待孩子的不聽話、不順從；有的父母當著孩子的面繪聲繪色地講述自己經歷過的一些可怕的事情；有的父母對某一事物或現象存在恐懼，在孩子面前毫不掩飾地表現出來，使孩子也深受其害。
2、特殊經歷：突發或意外事件的驚嚇，如自然災害或發生重大生活事件，可造成兒童心理應激，引起過度而持久的恐懼反應。
3、遺傳因素：父母患有餘光恐懼症，會對子女產生影響。家系研究也發現，在恐懼症兒童的一級親屬中，社交恐怖和兒童焦慮障礙的發生率高。