小兒支原體肺炎治療主要包括抗感染和化痰治療。對於伴有喘息症狀者，可予以支氣管舒張劑霧化吸入治療；對於有缺氧表現者，予以氧氣吸入治療，抗生素選擇大環類脂類抗生素比如阿奇黴素、紅黴素等，阿奇黴素為首選藥物。化痰藥物可以選擇鹽酸氨溴索、鹽酸溴己新等，並注意多給寶寶空心掌拍背排痰。對於幾星期病情發現迅速的，予以腎上腺皮質激素治療。