先天性心臟病不是遺傳病，並不是說爸爸、媽媽有先天性心臟病，孩子就一定會有先天性心臟病。因為目前來說先天性心臟病的病因，並不十分的明確，可能跟孕期的感染、環境因素、某些藥物因素、某些基因的位點，以及變異有關係。
有的時候家長會說，孩子爸爸是個先天性心臟病，孩子也是先天性心臟病，或者說爺爺有先天性心臟病，孫子也有先天性心臟病，難道這不是遺傳病嗎？這不是遺傳病，再次重申，這只是一種巧合現象。目前來說，沒有任何一種類型的先天性心臟病，達得到或者說夠得上遺傳性疾病的標準。