新生兒出現先天性心臟病症狀有輕有重。症狀比較輕的患兒一般不容易被發現，往往是在體檢或者患有其他疾病進行聽診時能聽到心臟雜音。病情比較嚴重的心臟病患兒，出生後會有嚴重的缺氧，身上出現紫疳色，在哭鬧時哭聲很小，聲音很低弱，嘴唇會發生紫紺，呼吸急促、呼吸困難，患兒的精神狀態也不好。還會出現心室肥大後導致心前區凸起，胸部畸形。先天性心臟病的患者還會引起呼吸道感染，合併感染後嚴重還會導致心衰。