川崎病屬於自限性疾病，多數的患兒治療之後的預後比較良好，複發率並不是很高。也有的人因為治療不及時出現中大血管的損傷，沒有得到及時緩解，特別是冠狀動脈出現擴張，可能會發生冠狀動脈瘤，可以伴有心肌缺血、損傷或者心律失常，可能會遷延不愈，可能就會影響到孩子成年之後的身體的狀態，特別是心臟的損傷。多數的孩子如果經過正規的治療，冠狀動脈的擴張和小動脈瘤都可能達到有效治療的目標。但是也會有些留有血管壁的增厚或者彈性減弱等等，肯定會對成人期造成不良的影響。最主要的就是冠狀動脈的損傷，對孩子預後的影響是最主要的部分，可能會造成心律失常、心力衰竭、猝死或者缺血性的心肌病。所以一定要早期進行干預、治療，積極的治療之後多數的孩子能夠得到緩解。