小兒感染心內膜炎手術後是否會再次感染取決於治療早晚、病情的嚴重程度、是否有持續性的菌血症等。如果發現早，病情不嚴重的話，及時手術的情況下再次感染的風險並不高。因此儘早治療可以提高治癒率。在手術前如果感染未能有效控制，術後再次感染的風險高，所以為了避免手術後再次感染，應該在術前、術後都要用敏感的抗生素治療3-4周。