腦發育的不良因素包括母親年齡低於16歲或者是35歲以上的高齡，孕期長期接觸吸菸、喝酒及放射線，有糖尿病，高血壓等病史。父母近親結婚及母孕期病毒感染史，宮內缺氧等。該病是以上多種因素導致的大腦、腦幹及小腦的發育異常。比較常見的有腦穿通畸形、腦脊膜膨出、無腦回畸形、皮層發育不良、蛛網膜囊腫、胼胝體發育不良、小腦發育不良等。