小兒先天性尿道下裂手術費用與就診醫院級別、手術方法、尿道下裂程度都有關係。就診醫院級別越高，手術費用越高，比如三甲醫院尿道下裂手術費用在2200元左右，再有就是尿道下裂分龜頭冠狀溝型、陰莖型、陰囊型、會陰型等不同程度，會陰型最重，手術複雜程度也高，手術費用也就高。再有就是尿道下裂手術分為陰莖下彎矯形和尿道重建手術兩部分，有的患者可一期同時做，有的需要分期做。那麼發生的費用也就不同。總體說來，三甲醫院陰莖型尿道下裂一期修復的費用大約1.5～2萬元左右。