手足口病是由多種腸道病毒引起的急性傳染病，本病的傳染源包括患者和隱性感染者，流行期間患者為主要傳染源，病毒主要存在於血液、鼻咽分泌物及糞便中，其中糞便中病毒排除時間為4-8周，一般以發病後一週內傳染性最強。散發期間隱性感染者為主要的傳染源，手足口病主要經糞-口途徑傳播，可以經呼吸道飛沫接觸和密切接觸傳播，本病傳染性強。患者和病毒攜帶者的糞便、呼吸道分泌物，以及患者的黏膜皰疹液中含有大量病毒，接觸汙染的手、日常用具、衣物，以及醫療器具等均可感染，其中汙染的手是傳播中的關鍵媒介，在流行地區，蒼蠅、蟑螂可機械性的攜帶病毒，在傳播中也起到一定的作用。