手足口病住院的指證有：1.年齡小於三歲，因為引起手足口病的病毒容易侵犯腦神經，年齡小的兒童機體抵禦病邪的能力差，更容易發生腦幹腦炎等危及生命；2.高熱不退，經過積極抗病毒治療72小時，體溫仍反覆不易降，這種情況也有發生重症手足口的可能，建議住院治療；3.發病期間出現肢體抖動、寒戰，不排除病毒引起毒血癥的可能，也建議及時就診。