大部分陰莖硬結症病程分為兩個階段，活動期持續6-18個月，表現為痛性勃起和陰莖畸形。靜止期主要以不可逆畸形為特點：1.陰莖硬結，所有患者均有大小數目不等的陰莖硬結，常位於陰莖背面及側面，也可位於腹面。2.痛性勃起，隨著炎症的控制，部分患者可能6個月左右緩解；94%的患者在18個月內緩解。3.陰莖畸形，陰莖向背側彎曲最為常見。4.性交困難和性功能障礙，可出現勃起疼痛，性交痛及陰莖嚴重畸形，可導致性交困難。5.精神狀況，如焦慮、抑鬱等，多數是由於勃起疼痛，陰莖畸形導致性交困難等所致。