女性生殖器皰疹在發病期間應該及時的使用抗病毒藥物治療，比如內服阿昔洛韋、伐昔洛韋、更昔洛韋等等藥物，外用干擾素凝膠、阿昔洛韋乳膏、噴昔洛韋乳膏等進行治療。
如果局部的皰疹破裂可以使用預防感染的藥膏，比如夫西地酸乳膏、百多邦軟膏等進行治療。對於女性生殖器皰疹，一般來講1-2周之內是可以逐漸的結痂、乾涸、痊癒的。
但是當機體免疫力下降的時候容易復發，所以一定平時要注意生活作息規律，不要過於勞累、熬夜，保持良好的生活習慣。另外飲食要清淡，不要吃過於辛辣、刺激的食物。在皰疹發作期間還要注意避免與他人接觸，以免傳染他人。