嬰兒溼疹的治療包括以下幾個方面：
1、基礎治療，孩子貼身穿的衣物以純棉、寬鬆、涼爽為主，避免各種可能的誘發因素。日常生活中注意觀察孩子溼疹的發作，是否與接觸某種物質或食用某種食物有關，如果有明確的相關性就儘量避免接觸或避免食用。不要不敢洗，也避免過度洗澡，溼疹是潮溼導致的這種說法是錯的，溼疹只是一個病名，無論是潮溼、多汗還是乾燥都可能會引起溼疹，所以可以正常洗浴，但是水溫不宜過高，也不建議搓洗，浴後應用潤膚劑恢復皮膚的屏障功能。
2、外用藥物治療，嬰兒溼疹的外用藥物要根據溼疹皮損的特點來選擇，例如在急性滲出期，滲液比較多的時候可以外用3%的硼酸溶液或氧化鋅油。無滲出或滲出不多的時候，可以用弱效的糖皮質激素軟膏，或糠酸莫米松這一類中效糖皮質激素軟膏，這些激素類軟膏不建議長期、大量塗抹於面部、腋下等皮膚薄嫩部位，儘量少用。
3、系統藥物治療，症狀緩解以後可以用鈣調磷酸酶的抑制劑，例如他克莫司和吡美莫司。
注意一點，因為嬰兒藥物的選擇是非常有限的，大部分藥物使用說明書都建議兩歲以上使用，並不是說兩歲以下的嬰兒用這些藥物有明顯副作用，而是嬰幼兒都不納入藥物試驗的對象。這些藥物在兒童中的安全性、有效性還沒有統一的認知，所以治療嬰兒溼疹的藥物，一定要在專業醫生指導下安全、合理的使用。