褪黑素是人體自然產生的，是人類和哺乳動物的松果體產生的一種胺類激素，短時間適量服用褪黑素不會造成明顯的副作用。但是如果長期大量服用褪黑素，可能會影響人體正常分泌褪黑素的功能。正常時，人體內褪黑素的含量較少，過多服用褪黑素，可能會導致人體內甲狀腺素、腎上腺素濃度相對降低，使人精神萎靡、睏倦、欲睡。此時容易出現注意力分散、反應理解慢、敏感度降低，開車時容易發生交通事故。臨床上有服用者，感到記憶力下降，這可能與口服褪黑素有一定關係，服用高劑量的褪黑素，可能使血管收縮，增加中風的危險。