蹠疣的治療選擇的外用藥比較多，臨床上常用的就是5%的五氟尿嘧啶軟膏，10%的水楊痠軟膏，10%的乳霜軟膏等，這一部分的藥物都具有明顯的刺激性或者腐蝕性，在應用時應避免傷害到正常的皮膚，治療時要詳細按照說明進行治療。較少的蹠疣臨床上一般不採取外用藥物治療，大多采取冷凍治療或者二氧化碳激光，微波，高頻電離子治療。