尋常疣最常用的治療方法有冷凍、CO2激光、電灼以及光動力療法。若不宜採用物理方法治療的患者，可採用咪喹莫特軟膏治療。若為難治性尋常疣，可每週一次局部注射平陽黴素。若為多發性疣，可使用維生素D3皮損內注射。此外，由於尋常疣是由於人類乳頭瘤病毒感染皮膚引起的。所以平時應注意提高自身免疫力，避免搔抓皮膚防止受傷導致感染，同時可以使用免疫調節劑，如干擾素、左旋咪唑、胸腺肽等藥物治療。