尋常疣的治療有多種方式，但不能確定哪一種就是特別有效的根治方法。一般根據尋常疣的部位，大小，範圍等等選擇不同的治療方式。如果是單獨孤立的尋常疣，而且疣體不大，一般採取冷凍治療的辦法，如果疣體較大較多，可以分次冷凍，或者配合免疫治療，比如注射干擾素治療的辦法。當然，如果疣體有的仍然有融合，而多次治療無效，也可以選擇手術切除，或者是光動力治療。