如果孩子出現功能性消化不良，有一些可能是能夠自愈的，有一些則不能夠。功能性消化不良並不是器質性的病變，可能會持續的、反覆的發作，或者存在像上腹痛、腹脹或者脹氣、厭食、噁心，包括嘔吐等等表現，考慮可能存在功能性消化不良。
對於功能性消化不良的病因來講，是多種因素綜合作用而造成的，往往和飲食、環境、精神心理因素是有關係的，並不是特別明顯的器質性病變，所以對於功能性消化不良的治療，藥物治療效果並不是特別滿意，更多的是去幫助患兒建立良好的飲食習慣，包括能讓他去正常的生活，包括解除精神和心理因素，患兒的功能性消化不良就有可能會自行緩解。有些可能也和飲食，比如和奶瓶有關係，通過調整餵養的技巧，孩子的症狀也可以得到緩解。