過敏性咽炎首先要明確是否是過敏性咽炎，可以通過過敏原測試或者血清的IgE抗體的檢查，來明確患者是否處於過敏狀態，是否是過敏性鼻炎。可以用針對抗過敏的藥物，也就是抗組胺藥和抗白三烯的藥物。抗組胺藥包括氯雷他定、西替利嗪、咪唑斯汀、左西替利嗪等，可以根據情況選擇。
抗白三烯類的藥物是孟魯司特鈉，也可以選擇使用。除了這些藥物，如果患者還有其他咽炎不適，可以給予清咽利喉的輔助治療藥物。最好能明確過敏原，明確過敏原的好處是可以做到有效隔離過敏原的接觸，所以如果過敏原測試能判斷是什麼過敏原，首先要避開這些過敏原。假如是空氣中的花粉過敏，到花粉季的時候最好戴口罩，儘可能減少接觸。