口腔粘膜病可以使用複方硼砂漱口水，或依沙吖啶漱口水含漱，每日4-6次，這兩者都可以有效的起到抑菌消炎的作用。同時如果在恢復期的時候，可以使用康復新液含漱，能起到促進粘膜癒合的作用。可以口服維生素b12片、維生素c片補充營養。如有紅、腫、熱、痛等炎症症狀，還需要口服頭孢類消炎藥如頭孢克肟膠囊。如果是由病毒感染所引起的粘膜病，比如皰疹性口炎，則需要口服抗病毒藥物如阿昔洛韋。如果是由免疫反應所引起的，比如天皰瘡，需要使用免疫調節劑如胸腺素、轉移因子等。