六味地黃丸對飛蚊症治療沒有效果，目前沒有循證醫學證據可以證明六味地黃丸可以治療飛蚊症。
飛蚊症又稱玻璃體混濁，藥物治療療效並不確切。對於生理性的飛蚊症對患者的視力通常沒有影響，一般不需要進行特殊治療，如果有需要可以適當口服卵磷脂絡合碘，來減輕玻璃體混濁的症狀。卵磷脂絡合碘可以加速玻璃體組織、視網膜組織的代謝，促進玻璃體混濁的吸收，從而緩解飛蚊症。如果是病理性的飛蚊症，除了運用碘劑之外，還需要應用相關的藥物進行針對性的治療，例如針對出血所導致的飛蚊症，可以使用止血類的藥物，對於炎症所導致的飛蚊症，可以考慮使用免疫抑制劑或者激素類藥物進行治療。