非典型分枝桿菌感染最常見的眼部表現是鞏膜炎或角膜炎。非典型分枝桿菌廣泛分佈於自然界，家畜、土壤、灰塵和水中均可發現非典型分枝桿菌株。藥物治療可考慮分3個級別：一級採用三重藥物方案，包括異煙肼、利福平、乙胺丁醇，至少治療1年，該方案適用於鞏膜炎病變穩定，分枝桿菌持續培養陽性者。二級治療包括上述3種藥物，每天加鏈黴素至少1年。當開始治療證明有效後鏈黴素可減至每週2～3次，該治療方法適用於鞏膜炎呈慢性進展的，對一級治療無反應或中止一級治療後復發的患者。三級治療聯合5～6種藥物，二級藥物加用頭孢噻吩、乙硫異煙肼、環絲氨酸米諾環素、磺胺甲基異惡唑和其他利福平衍生物。更合理的治療方案依賴體外藥敏試驗。