頭疼多半分為兩大類，即原發性或者特發性頭疼，以及繼發性頭疼，具體如下：
1、原發性或者是特發性頭疼，指沒有顱內器質性疾病導致的頭疼，一般頭疼病史較長，間斷出現，發作一次持續一段時間後，即便沒有特殊治療也能自愈，為良性原發性頭疼或者特發性頭疼，如偏頭疼、緊張性頭疼、叢集性頭疼。
2、繼發性頭疼，繼發於全身系統的疾病，也可以繼發於顱內。全身系統性疾病有高血壓病、抑鬱症，這些可以引起頭疼，顱內的器質性的病變有腫瘤、腦積水引起的高顱壓，以及腦炎、腦膜炎、腦血管病、腦出血、蛛網膜下腔出血、大面積腦梗死、靜脈竇血栓形成、頭顱外傷、外傷性的硬膜下血腫等。
需要根據不同的病因治療，原發性的頭疼主要是用非甾體類的消炎止疼藥來止疼治療。