頭疼可以是繼發性的症狀，可以繼發性與顱內外的器質性的急變導致，比如全身性的疾病，發燒可以引起頭疼，高血壓病可以引起頭疼，各種的代謝中毒性腦病也可以引起頭疼。顱內的感染、腦炎、腦膜炎、顱內的出血、蛛網膜下腔出血、腦出血、顱內的靜脈竇血栓形成、顱內的外傷、硬膜下血腫、顱內的腫瘤都可能會引起頭疼。如果患者頭疼的病史長間斷出現，發作一次持續一段時間可以自愈，可能是良性頭疼也叫原發性頭疼，可以是偏頭疼、叢集性頭疼、緊張性頭疼。