通常慢性結腸炎主要症狀有腹痛、便不成型、便次數增多，但不同於急性腸炎，沒有噁心、嘔吐、發燒等症狀。一般著涼、進食辛辣食物或者喝酒容易導致便次增多症狀加重，如果是炎症性腸病，如潰瘍性腸炎一般以粘液膿血多見，也常伴有腹瀉、腹痛，嚴重的直腸潰瘍患者會伴有肛門下墜、滴鮮血。全結腸潰瘍患者甚至有慢性消耗、惡病質，甚至併發下消化道大出血、穿孔、中毒性巨結腸等併發症，可以通常腸鏡檢查配合病理明確。