感染性結腸炎的治療，一般以殺菌抗炎為主，可以使用柳氮磺吡啶、美沙拉嗪、甲硝銼、阿莫西林、腸炎寧等藥物。藥物在殺死有害菌的同時，也會破壞體內有益菌平衡，所以要適當補充些益生菌，也可服用些中藥來調節結腸功能。生活中患者要注意腹部保暖，餐具要充分消毒，不吃腐敗食品，飲食習慣要以多素少肉為主。忌吃辛辣、生冷的食物。不要過於勞累，保證充足的睡眠時間。