運動神經元病的確診主要靠病理檢查，部分患者還需要基因檢測，但是在臨床實踐中由於各種原因，進行病理檢查的患者數量非常少，大部分都是臨床診斷。
運動神經元病的患者主要表現為四肢無力、肌肉萎縮、言語不清、飲水嗆咳、吞嚥困難等，體檢可以發現腱反射亢進、肌張力增高、病理徵陽性等，肌電圖檢查可見神經源性改變。由於運動神經元病的臨床症狀表現不特異，早期容易誤診。