腦癱的病因分為遺傳性的病因和後天性的病因，遺傳性的病因有家族遺傳病史，父母近親結婚以及在家屬中出現腦癱、智力障礙或先天畸形者，幼兒發生腦癱的概率就會增加。後天的因素又包括出生前的病因、圍生期的病因和出生後的病因。出生前的病因包括胚胎期腦發育畸形、孕婦妊娠期重症的感染、嚴重的營養不良、外傷、妊娠毒血症、糖尿病、放射線照射等等，這些原因影響了胎兒腦發育，導致永久性的腦損害而出現腦癱。
還有圍生期的病因，這個時期引起腦癱的主要病因是早產。無論是分娩時間過長、臍帶繞頸，還是胎盤早剝脫、前置胎盤導致胎兒腦缺氧，或者由於產傷、難產、出血性疾病導致的顱內出血等都會導致患者腦癱。出生後的病因包括中樞神經系統感染、中毒、頭部的外傷、嚴重的窒息、心臟的停搏、持續的驚厥以及顱內的出血等疾病。